Koronavirus SARS-CoV-2 ja sen aiheuttama tauti COVID-19 (Yleinen keskustelu)

[halcyon]

Päivitys: Kansainväliset varmistetut 2019-nCoV tartunnat (poislukien Kiina/Taiwan/Hong Kong/Macao) perustuen 4.4.2020 illan virallisiin lukuihin. HUOM! Logaritminen pystyasteikko.

Kuten graafista näkyy, edes kansainväliset varmistetut tartunnat yhteensä ei noudata mitään kaunista käyrää, vaan päivästä toiseen on elämistä, testauksen määrän (ja muiden muuttujien) mukaan. Viimepäivät kasvua on ollut yli potenssifunktion (punainen katkoviiva) ennusteen verran, mutta kaukana eksponentiaalisesta (harmaa katkoviiva).

Yllä oleva eksponenttitrendi on piirretty parhaalla osuvuudella (eli käytännössä: olettaen, että ensimmäisiä tartuntoja ei ole löydetty, vaan ne olisivat ajassa tääksepäin ainakin viikon aikaisemmin kuin ensimmäinen diagnosoitu tapaus 21.1.2020). Tuo eksponentiaalinen trendi on siis enemmän ajatusleikki, ei mikään ennuste, eikä luonnollisesti trendinä ole kuvaava. Se on enemmänkin vertailuksi kasvun vauhdista ja suhteena potenssifunktiolle.

Se mitä olen lukenut SARS/MERS/nCoV-samanlaisuudesta, niin seuraavat pitävät mahdollisesti paikkansa:

- ihmisestä ihmiseen tartunta (varmistettu)
- oireeton tartunta (raportoitu, ei varmistettu)
- tartunnan voi saada sairastuneen ulosteista (eikä ainoastaan sylkierityksen kautta, kiinalaiset raportoineet)
- PCR-testillä "parantunut"/"oireeton" potilas voi erittää virusta vielä 6-7-viikkoa ulosteissaan parantumisajankohdan jälkeen (SARS:in kohdalla varmistettu)
- voi liikkua lajien välillä, eli ihminen-kotieläin-ihminen infektio on mahdollinen (SARS:in kohdalla varmistettu)
- mutaatiot luonnollisesti nopeasti kopioituvassa viruksessa mahdollisia (mutta 2019-nCoV vaikuttaisi geneettisesti olevan tältä osin potentiaalisesti hieman vähemmän muuntuva, kuin esim. SARS)

Lähteet: enpä nyt pitänyt kirjaa niistä, oli useampia papereita, täytyy katsoa jos jaksan/ehdin kaivamaan esiin selainhistoriasta huomenna.

Kuten aina, mahdolliset tulkinta-/ymmärrysvirheet ovat allekirjoittaneen, oikaista saa.

 

[Riksteri]

Suuret kiitokset @halcyon, kun jaksat tuoda lisätietoa ja seurata tapahtumia maailmalla. Näitä on ilo lueskella.

 

[Kautium]

Tämä ei ole kaiketi mikään poikkeuksellinen tilanne, mutta vahvistus kuitenkin sille, että virus voi tarttua raskaana olevalta äidiltä lapselle ennen synnytystä.

Koronavirukseen sairastunut nainen synnytti lapsen: 30 tuntia vanhan vauvan testi positiivinen – lääkärit uskovat taudin tarttuneen jo kohdussa

Kiinassa koronavirukseen sairastuneen naisen synnyttämän lapsen uskotaan saaneen tartunnan jo kohdussa. Tapauksesta kertovat muun muassa Reuters ja BBC.

www.mtvuutiset.fi

 

[Algron28]

Sankarilääkäri Li Wengliangia suitsutetaan Kiinassa: varoitti koronaviruksesta jo varhain, poliisi kolkutteli heti – ja sitten Li sairastui itse

Ylen uutinen viruksen alkuvaiheessa havainneista lääkäreistä ja Kiinan viranomaisten hyssyttelystä.

 

[dominik]

Toisaalta luin aiemmin päivällä kirjoituksen, että kiinassa aloitettiin uuden sars koronarokotteen käyttö joulukuun alusta, eli samoihin aikoihin, kun tämä rutto alkoi. Oli kuulemma sen kehittelijät varoittanut, ettei se ole vielä valmis, mutta alkoivat sillä keskeneräisellä rokottamaan siitä huolimatta, kun laki tuli voimaan 1.12 ja rokottaminen piti aloittaa oli valmista tai ei. Ilmeisesti juuri tuolla wuhanissa sen käyttö ensimmäisenä aloitettiin. Onko moiselle väitteelle löytynyt mitään parempia vahvistuksia?

 

[Corle]

Nopeestihan siitä tuntuis paranevan.

Koronapotilas pääsi sairaalasta Rovaniemellä – kiinalaisnaisesta otetut uusimmat näytteet ovat osoittautuneet negatiivisiksi

Viime viikon tiistaina Lapin keskussairaalaan tuotu kiinalaismatkailija on hyväkuntoinen eikä hänellä ole enää oireita.

yle.fi

 

[Käyttäjätunnus:]

Kiinalaiset voisivat ottaa mallia suomalaisista. Eihän tässä ole mitään hätää, mitä ne siellä oikein vouhkaavat?

 

[Tonnin Seteli]

Eli siis jokaisen nuhaisen tai väsymystä ja lihaskipua kokevan pitää ymmärtää olevansa mahdollinen Wuhan-tapaus sekä saada itsensä testatuksi, jotta leviäminen loppuisi. Ei vaikuta mahdolliselta, ellei näitä saada alusta asti kiinni ja näin estettyä viruksen maahantulo.

Tämä. Aika paljon on pyydetty. Minä koen väsymystä unirytmin takia ja lihas- tai nivelsärkyä funktionaalisista syistä noin viikottain myös ollessani täysin terve. Käytän joskus jopa maltillisesti lääkkeitä moisen takia. Nuhakaan ei ihan vieras ilmiö ole ilman edes perusflunssaa, jos vähän viileämmässä mökissä yöpyy ja/tai savua hengittelee. Paha siitä on mennä tartuntataudin kohdatessa ensioireita kuin jälkeenpäin.

 

[Zener]

CNN uutisissa pohdiskelevat, että minne on kadonnut Kiinan presidenttii:

China says Xi Jinping is directing its Wuhan coronavirus response, but he's nowhere to be seen | CNN

Since he first intervened in the Wuhan coronavirus crisis in late January, ordering "all-out efforts" to contain its spread, Chinese President Xi Jinping has been personally directing the country's response.

edition.cnn.com

 

[Walla]

CNN:llä on juttua joskus aikaisemmin itsekin pohtimastani spekuloimastani, että jos virus pääsee leviämään ei sitä välttämättä enää saada pois kierrosta, vaan käytännössä siitä tulee pysyvästi uusi kausi-influenssa virus, kuten H1N1:stä 2009:

Will the new coronavirus burn out like SARS ... or is it here to stay? | CNN

Nearly two decades after he was treated, former severe acute respiratory syndrome (SARS) patient Alex Lam is still haunted by his experience.

edition.cnn.com

 

[tuoppi´]

CNN:llä on juttua joskus aikaisemmin itsekin pohtimastani spekuloimastani, että jos virus pääsee leviämään ei sitä välttämättä enää saada pois kierrosta, vaan käytännössä siitä tulee pysyvästi uusi kausi-influenssa virus, kuten H1N1:stä 2009:

Will the new coronavirus burn out like SARS ... or is it here to stay? | CNN

Nearly two decades after he was treated, former severe acute respiratory syndrome (SARS) patient Alex Lam is still haunted by his experience.

edition.cnn.com

Niinhän sitä tuppaa käymään. Aika vaikea näitä viruksia (tai muitakaan tauteja) on kokonaan saada pois ja silloinkin vaaditaan vuosikymmeniä.

 

[Käyttäjätunnus:]

Professori Neil Ferguson Lontoon Imperial Collegesta arvioi Kiinassa tapahtuvan tällä hetkellä noin 50 000 uutta tartuntaa päivässä:

 

[Xirka]

Kiinalaiset voisivat ottaa mallia suomalaisista. Eihän tässä ole mitään hätää, mitä ne siellä oikein vouhkaavat?

Ihan oikein eihän Suomessa olekaan mitään hätää. Muutenkin ihmetyttää tämän ketjun maailmanlopun maalaus. Viruksia tulee ja menee, kuuluu normaaliin elämän kiertokulkuun.

 

[halcyon]

Ihan oikein eihän Suomessa olekaan mitään hätää. Muutenkin ihmetyttää tämän ketjun maailmanlopun maalaus. Viruksia tulee ja menee, kuuluu normaaliin elämän kiertokulkuun.

Toki tämä on totta, että virukset ja muut patogeenit kuuluvat elämän kiertokulkuun.

Sen takia onkin hieman outoa:

• Miksi Kiina on laittanut viimeisten tietojen mukaan osittaiseen karanteeniin/liikkumiskieltoon yli 30 kaupunkia ja yli 150 miljoonaa ihmistä? Ja on valmis ottamaan jopa 2+% BKT laskun kansantalouteensa
• Miksi WHO on luokitellut taudin PHEIC-luokkaan?
• Miksi Yhdysvaltojen CDC on määrännyt pakollisen karanteenin kaikille Wuhanista tuleville, ensimmäistä kertaa 50 vuoteen (ei tehnyt sitä SARS/MERS/H5N1 epidemioissa, jossa kuolleisuus on merkittävästi korkeampi alusta saakka)?
• Miksi Venäjä, Mongolia, Hong Kong ja muut maat ovat sulkeneet kokonaan Kiinan rajansa?
• Miksi melkein kaikki kv-lentoyhtiöt ovat keskeyttäneet kaikki lennot Wuhaniin/Wuhanista (evakuointilennot sitten suoraan karanteeniin, osassa maita sotilastukikohtiin)?
• Miksi osa maista, esim. Israel evää maahantulon Kiinasta (tai laittaa pakkokaranteeniin) ja on alkanut perumaan jo myönnettyjä viisumeita?
• Miksi Kiinasta tihkuu kentältä koko ajan tietoa, että asiat eivät ole niin kuin Kiinan viralliset diagnosoidut luku antaa ymmärtää?

Joku tässä nyt on outoa omastakin mielestäni:

• joko ylireagoidaan (ei vain Kiinassa, vaan ihan ympäri maailmaa, mukaan lukien CDC/WHO/monen maan epidemologit)
• ...tai jotain tapahtuu, mikä ei ole vielä täysin hahmotettu ja siksi ollaa tahallaan varovaisia
• ...tai Kiinassa tapahtuu jotain, mikä ei vielä laajasti ole vuotanut tiedotusvälineissin, joka antaa suuremman syyn olla varovainen

Eivät kaikki tahot voi yhtä aikaa olla yhtä oikeassa (Kiinan viranomaiset ja toisaalta esim. THL). Joku yli- tai alireagoi pahasti.

Itse olen vielä rauhallisin mielin asian suhteen, koska en näe vielä länsimaissa räjähdysmäisesti kasvavia epidemioita enkä kuolleisuutta.

Kunhan vain ihmettelen ääneen, että 2019-nCoV-viruksen usean tahon väittämä suhteellinen harmittomuus ja epidemiariskin vähäisyys, eivät mitenkään vastaa jo käytäntöön pantuja toimenpiteitä.

Mutta ei olisi ensimmäinen kerta, kun WHO (tai THL) on väärässä tai asioihin reagoidaan aivan väärässä suhteessa

 

[mRkukov]

Toisaalta luin aiemmin päivällä kirjoituksen

Onko moiselle väitteelle löytynyt mitään parempia vahvistuksia?

Kuulin ihan samaa! Olikohan serkun enon naapuri, joka kertoi että iltalehden salakeskustelualueella oli postaus kalifornialaisen vpn kautta että suomen lapissa 30 hengen turistiryhmä oli saanut tartunnat juuri rokotteesta! Mikä yhteensattuma!

Jos kerran luit asiasta jostain, niin voisit edes linkin kaivaa selaimesi historiasta.

 

[omenanraato]

ei tehnyt sitä SARS/MERS/H5N1 epidemioissa, jossa kuolleisuus on merkittävästi korkeampi alusta saakka

Kyllähän tämä on nyt jo enemmän tappanut kuin SARS:

Koronavirus tappanut Manner-Kiinassa jo enemmän ihmisiä kuin sars – 361 kuollut, tartuntoja Kiinassa vahvistettu jo yli 17 200

Koronavirus on nyt tappanut Manner-Kiinassa enemmän ihmisiä kuin 2000-luvun alun sars-epidemia. Kiinan viranomaiset vahvistivat tänään 57 uutta kuolonuhria, joten yhteensä kuolemantapauksia on maassa nyt 361.

www.mtvuutiset.fi

Ja kun edelleenkin tilanne on se, että 30% on kuollut ja 70% parantunut. Se on aika hiton iso luku.

Spoileri

 

[mRkukov]

Ja kun edelleenkin tilanne on se, että 30% on kuollut ja 70% parantunut. Se on aika hiton iso luku.

Vertaat aivan vääriä lukuja keskenään. Todetuista 28k tapauksesta alle 2% kuollut. Toteamattomia tapauksia varmaan ainakin toinen samanlainen, eli kuolleita alle 1% kaikista.

 

[Taivaankulkija]

Vertaat aivan vääriä lukuja keskenään. Todetuista 28k tapauksesta alle 2% kuollut. Toteamattomia tapauksia varmaan ainakin toinen samanlainen, eli kuolleita alle 1% kaikista.

Pitäisikö syöpäkuolleisuuttakin katsoa diagnosointi hetkellä eikä vaikka esim. Vuoden kohdalla kuolleiden määrällä? Kätevää, kun syöpien aiheuttama kuolleisuus tippuisi melkein nollaan.

 

[perato]

Viimeisimpien päivien kehitys. Tuo Outside China taisi ottaa hyppäyksen noiden Japanin risteilijätapausten johdosta.
Kiinasta uusimmat luvut oli 27000 ja 70 uutta kuolintapausta.

 

[mRkukov]

Pitäisikö syöpäkuolleisuuttakin katsoa diagnosointi hetkellä eikä vaikka esim. Vuoden kohdalla kuolleiden määrällä? Kätevää, kun syöpien aiheuttama kuolleisuus tippuisi melkein nollaan.

Öö... ehdotat siis mitä? Ettei tämän viruksen kuolleisuutta lasketa ollenkaan ennen ensi vuodenvaihdetta?

 

[Porsashyeena]

Melko turhaa arvuutella kuinka moni on saanut tartunnan. Osa potilaista käännytetään kotiin sairastamaan ilman tutkimuksia ja sairaaloissa pulaa testikiteistä joilla virus todetaan.

 

[omenanraato]

Vertaat aivan vääriä lukuja keskenään. Todetuista 28k tapauksesta alle 2% kuollut. Toteamattomia tapauksia varmaan ainakin toinen samanlainen, eli kuolleita alle 1% kaikista.

Millä perusteella vertaan vääriä lukuja?

Ainut mikä merkkaa on se kun tauti on ohi. Eli olet joko parantunut, tai haudassa. Niitä on yhteensä se noin 1800 ja niistä 30% kuollut.

Tartunnan saaneita voi olla vaikka 20 miljoonaa, mutta niin kauan kuin heillä on tauti, sillä ei ole mitään merkitystä siihen moniko niistä kuolee. Vasta kun paranee/kuolee tietää sen.

 

[David ":DA" Imodium]

Vertaat aivan vääriä lukuja keskenään. Todetuista 28k tapauksesta alle 2% kuollut. Toteamattomia tapauksia varmaan ainakin toinen samanlainen, eli kuolleita alle 1% kaikista.

Vertailet vääriä lukuja keskenään. Todettujen tapausten lukumäärä tulee ottaa 6-7 päivää aiemmalta päivältä, jossa tuo 6-7 edustaa keskimääräistä aikaa taudin toteamisesta kuolemaan, niissä tapauksissa jotka ovat kuolemaan päättyneet. Eli tälle päivälle noin 565 / 9700 ~ 6%. Wuhan ja Hubei määräävät tilastot tällä hetkellä ja itse taudin kuolleisuudesta ei ole vieläkään luotettavia arvioita.

 

[Griffin]

Kun tartunta-aika on useampi viikko ja jälkisairaudet voivat tappaa vielä jonkin ajan päästä, niin eipä sitä kuolleisuutta pysty sanomaan muutaman kuukauteen, jos se ei rupea ihan huimaksi. Sitäkään ei tiedä, laukaiseeko tämän sairastaminen mitä muita sairauksia, kuten sikainfluenssako se oli? Esimerkiksi teki *(Sairastipa taudin tai otti rokotuksen)..

Kunhan nyt edetään edes pari kuukautta, niin asia alkaa selvitä paremmin.

 

[mRkukov]

Millä perusteella vertaan vääriä lukuja?

Ainut mikä merkkaa on se kun tauti on ohi. Eli olet joko parantunut, tai haudassa. Niitä on yhteensä se noin 1800 ja niistä 30% kuollut.

Tartunnan saaneita voi olla vaikka 20 miljoonaa, mutta niin kauan kuin heillä on tauti, sillä ei ole mitään merkitystä siihen moniko niistä kuolee. Vasta kun paranee/kuolee tietää sen.

Eli nyt väität että tartunnan saannista kuolet tai parannut aina saman ajan kuluessa? Eli joko tai. Kukaan ei kuole kahdessa päivässä ja kukaan ei sairasta yli viikkoa?
Noita lukuja voit verrata noin myöhemmin, mutta et todellakaan tässä kohtaa kun ne on prosentteja kokonaismäärästä.

Vertailet vääriä lukuja keskenään. Todettujen tapausten lukumäärä tulee ottaa 6-7 päivää aiemmalta päivältä, jossa tuo 6-7 edustaa keskimääräistä aikaa taudin toteamisesta kuolemaan, niissä tapauksissa jotka ovat kuolemaan päättyneet. Eli tälle päivälle noin 565 / 9700 ~ 6%. Wuhan ja Hubei määräävät tilastot tällä hetkellä ja itse taudin kuolleisuudesta ei ole vieläkään luotettavia arvioita.

Olen tuon itse sanonut jo varmaan 5 kertaa että kuolleita pitäisi verrata noin viikon vanhoihin tilastoihin, mutta ei "tartunnan saaneisiin" joka ei todennäköisesti pidä ollenkaan paikkaansa.

E: "selvinneet" tulee ilmeisesti pari-kolme viikkoa jäljessä ja kuolleet noin viikon. Onko näistä ajoista parempia arvioita?

 

[Zigh]

Millä perusteella vertaan vääriä lukuja?

Ainoa luku mikä noista suunnilleen voi pitää paikkansa on kuolleiden määrä. Kaksi muuta lukua riippuu täysin siitä kuinka paljon testejä on pystytty tekemään. Etenkin parantuneiden osalta epäilen, että aika harvaa testataan oireiden loppumisen jälkeen.

 

[halcyon]

Kyllähän tämä on nyt jo enemmän tappanut kuin SARS:

Ei ole. Kuolleita on enemmän raportoitu Kiinassa, kuin SARS-2003 epidemian aikana raportoitiin. SARSin lukuja pimitettiin ainakin 3kk, enenn kuin tiedot vuosivat ulos. Ja vieläkin SARSiin kuoli 2003 epidemiassa enemmän globaalisti, kuin on globaalisti toistaiseksi kuollut (raportoidusti) 2019-nCoV-koronavirukseen (5.2. mennessä). Eli tässä kohtaa uutisotsikot ovat olleet virheellisiä.

SARSin kuolleiden määrä maailmassa (ei ainoastaan Kiinassa) 2003 epidemiassa: 774
2019-nCoV kuolleiden määrä maailmassa toistaiseski 2019-2020 epidemiassa (5.2.2020 mennessä): 565
Lähde1: Severe acute respiratory syndrome - Wikipedia
Lähde2: Operations Dashboard for ArcGIS

Se on totta, että todennäköisesti SARS:in globaalista kuolleiden määrästä, mikäli epidemia jatkuu vielä viikoja.

SARSin laskennallinen sairastumiskuolleisuus (CFR): 6.4% - 14%
2019-nCoV laskennallinen arvio sairastuneiden kuolleisuus toistaiseksi (todellinen vertailukelpoinen luku vasta epidemian päättymisen jälkeen (CFR): 2.6% - 6.5% (ensimmäiset 99 potilasta: 11%)
Lähde3: Case fatality of SARS in mainland China and associated risk factors. - PubMed - NCBI
Lähde4: Estimates of SARS death rates revised upward
Lähde5: SARS case-fatality rates
Lähde6: calthaus/ncov-cfr
Lähde7: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.01.27.20018952v1.full.pdf

HUOM! Kuolleisuus (mortality rate = kuolleet/tartunnan saaneet ≠ Case Fatality Rate = kuolleet/hoitoon otetut sairastuneet)

 

[mRkukov]

SARSin kuolleiden määrä maailmassa (ei ainoastaan Kiinassa) 2003 epidemiassa: 774
2019-nCoV kuolleiden määrä maailmassa toistaiseski 2019-2020 epidemiassa (5.2.2020 mennessä): 565

Ehkä tässä kohtaa voidaan jo aina varmuudella todeta, että tähän virukseen _tulee kuolemaan_ enemmän kuin SARSiin kuoli.

 

[omenanraato]

Eli tässä kohtaa uutisotsikot ovat olleet virheellisiä.

Missä kohtaa? Jos otsikko oli nimenomaan että manner Kiinassa tappanut enemmän.

 

[Zezekärppänen]

Ehkä tällä hetkellä liikaa tuijotellaan noita Kiinan lukuja, joiden luotettavuudesta ei ole mitään tietoa. Tällä hetkellä tauti leviää myös muissa maissa ja alussa ne tilastot näyttää vielä siltä että olisi kontrolloitavissa. Itse en jaksa kyllä millään uskoa että pystyttäisiin tämä leviäminen pysäyttämään.

Länsimaissa on varmaan jo paljon sairastuneita, joista who/thl/yms:llä ei ole mitään tietoa ja nämä tartuttavat tautia edelleen. Sairaita ei edes testata, koska näille ei ole ollut suoraa kontaktia kiinalaisiin. Pikkuhiljaa alkaa tulla siellä täällä esille keuhkokuumetapauksia ja sitten voidaankin jo todeta että tauti on levinnyt jo niin laajalle että sitä ei pystytä pysäyttämään. Mä uskon että nyt ollaan siinä vaiheessa että kaikki näyttää vielä hyvältä, mutta mitään ei ole tehtävissä.

Jos tuohon sairastuu tänä vuonna 10% maapallon ihmisistä, niin se tekee 0.75 miljardia ihmistä. Mitään varmaa tietoa ei vielä ole taudin tappuvuudesta ja siitä että kuinka moni sairastuneista tarvitsee sairaalahoitoa. Kiinassa terveydenhuolto meni täysin polvilleen ja samalla tavalla käy varmaan muissakin maissa. Kehitysmaissa tietenkin vielä huonompi tilanne. Suomessakin tulee vielä olemaan kova pula resursseista.

Länsimaissa on jo viikon/parin aikana ollut tapauksia, joista pitäisi kohta alkaa tulemaan tarkempaa tietoa tästä taudista. Jos kuolleisuus on edelleen 2% tai kasvaa siitä, niin kusessa ollaan. Itse kyllä veikkaan jotain 0,5% mutta sekin on ihan helvetisti, jos tämä leviää kaikkialle.

Finanssikriisi tähän sitten vielä kaupan päälle. Mä toivon että olen väärässä, mutta mun mielestä kaikki merkit näyttää siltä, että me ei olla vielä nähty mitään tän taudin suhteen.

 

[omenanraato]

Eli nyt väität että tartunnan saannista kuolet tai parannut aina saman ajan kuluessa?

Missä kohtaa olen puhunut ajasta? Tottakai toi luku pienenee kokoajan. Mutta jos sulla tänään sairastuu 10 miljoonaa ihmistä (eikä se leviäisi ollenkaan) joista kuolee viikon aikana 200 000, mutta kun tauti on kukistettu vaikka vuoden jälkeen, niin todellisuudessa kuoli 3 miljoonaa. Niin ei voida puhua 2% kuolleisuudesta, vaan 30%

Tässä korona keissistä tuo luku tottakai pienenee ja voi lopulta päätyä vaikka siihen kahteen prosenttiin, mutta yllä hetkellä niistä tiedoista mitä on ilmoitettu, niin 70% on parantunut, on se aika mikä vain. Eli silloin kun testit on negatiivisia.
Ja loput 30% on kuollut.

Pari päivää sitten se oli 50-50, josta voidaan päätellä, että luku tulee tippumaan rajusti, mutta yllä hetkellä tuo on ainut luku mistä voidaan päätellä yhtään mitään.

 

[Zeppelin]

Eipä noista virallisista luvuista voi juurikaan mitään johtopäätöksiä vetää kun ovat vahvasti alakanttiin sekä propagandan että myös sen takia ettei laskenta enää pysy tilanteen tasalla kun tapauksia on liikaa. Kuolleita tuolla näyttäisi paikalta tulevan videomatskun perusteella olevan jo paikat täynnä mm. sairaaloiden odotustiloissa ja muissa vastaavissa paikoissa.

 

[halcyon]

Olen tuon itse sanonut jo varmaan 5 kertaa että kuolleita pitäisi verrata noin viikon vanhoihin tilastoihin, mutta ei "tartunnan saaneisiin" joka ei todennäköisesti pidä ollenkaan paikkaansa.

Ongelma keskustelussa on se, että ihmiset käyttävät eri lukuja ja termejä viittaamaan eri asioihin JA erityisesti silloin kun epdiemia on vielä käynnissä/kasvamassa ja luvut vaihtelevat alueellisesti, hoidon mukaan, testauksen määrän mukaan ja muutenkin päivästä toiseen.

Epidemologit määrittävät tarkasti CFR-luvun epidemian jälkeen niistä sairastuneista (joilla on oireita ja ovat hoidossa) potilaista, jotka kuolevat. Eli eivät kaikista tartunnan saaneista tai edes vahvistetusti tartunnan saaneista, joissa on myös oireettomia (eli oireettomat tartunnan saaneet eivät päädy CASE-lukuihin).

Usein itse epidemian aikana puhutaan (senhetkisestä) kuolleisuudesta, joka on sitten kuolleiden määrä jaettuna vahvistetuilla tartunnoilla. Ja kuten todettu, ja itsekin hyvin olet monasti maininnut, tässä verrataan kahta kasautuvaa lukua, joiden välissä on vähintäänkin 5 päivän, ehkä jopa yli kahden viikon viive. Tämän takia luvut tarkentuvat vasta epidemian päätyttyä.

Kaikissa näissä luvuissa on epävarmuutta ja heittoja:

- Kaikkia tartunnan saaneita/sairastuneita ei diagnosoida (eivät päädy kuolleisuuslukuihin jakajaan), kaikki eivät sairastu/päädy hoitoon (eivät päädy CFR-lukuihin jakajaan)
- Kaikki kuolleet eivät päädy kuolleisuuslukuihin, vaan saavat kuolinsyyksi jonkun muun syyn (eli eivät päädy kuolleisuus/CFR-lukujen jaettavaan)

Eli kuten sanottu moneen kertaan, kuolleisuus ja jopa (arvioina) epidemian aikana lasketut CFR-estimaatit, ovat erittäin epävarmoja ja voiva sisältää paljon virheitä, erityisesti epidemian alun aikana ja vielä erityisemmin sen kasvuvaiheessa.

Tästä hyvänä esimerkkinä juuri se, että 17 vuotta SARS 2003-epidemian jälkeen ei vieläkään vallitse yksimielisyyttä siitä, mikä oli SARS-2003-epidemian CFR (arviot ovat karkeasti välillä 6.4%/Kiinalaiset ja 12.2%/toiset kiinalaiset tutkija). Joidenkin arvioiden mukaan SARS-epidemiassa ei-hoitohenkilökunnan sairastuneiden kuolleisuus oli SARS-epidemiassa 24.5% .
Lähde: Comparative Epidemiology of Human Infections with Middle East Respiratory Syndrome and Severe Acute Respiratory Syndrome Coronaviruses among Health... - PubMed - NCBI
Lähde: The severe acute respiratory syndrome epidemic in mainland China dissected. - PubMed - NCBI

 

[Griffin]

Niin tai näin, niin mitä tiheämmässä ihmiset asuvat ja mitä löperömpi suhtautuminen tautiin, niin sitä tehokkaammin se leviää.

 

[halcyon]

Missä kohtaa? Jos otsikko oli nimenomaan että manner Kiinassa tappanut enemmän.

Ei juuri tuossa otsikossa, mutta näissä muissa:

- "China's death toll from coronavirus surpasses SARS"
- "China's virus death toll spikes, more than SARS"
- "Coronavirus has already killed more than SARS"
- "Coronavirus: death toll passes Sars"
- "Coronavirus deaths more than SARS"

Netistä löytyy kymmeniä lisää. Suomalaiset uutiset olivat tämän suhteen keskimäärin enemmän oikeassa (mainitsivat Manner-Kiinassa tai Kiinassa).

Moni otsikko ei juuri eritellyt tuota Manner-Kiina sanaa, ja veikkaan, että moni lukija sai tämän takia väärän kuvan.

 

[David ":DA" Imodium]

Voisiko Hong-Kongin datasta tehdä johtopäätöksiä taudin globaalista käyttäytymisestä:

Latest Situation of Novel Coronavirus Inflection in Hong Kong

Latest Situation of Novel Coronavirus Inflection in Hong Kong

chp-dashboard.geodata.gov.hk

Siellä n. tuhannesta epäillystä on 2 % sairastunut, ja 15 % osalta ei ole vielä selvää. Kaikista epäilyistä n. 85 % on johtanut negatiiviseen tulokseen.

 

[Cereal killah]

Ehkä tällä hetkellä liikaa tuijotellaan noita Kiinan lukuja, joiden luotettavuudesta ei ole mitään tietoa. Tällä hetkellä tauti leviää myös muissa maissa ja alussa ne tilastot näyttää vielä siltä että olisi kontrolloitavissa. Itse en jaksa kyllä millään uskoa että pystyttäisiin tämä leviäminen pysäyttämään.

Ja eihän tämä mitenkään hetkessä leviä...oltaisiinkohan esim. EU-alueella nyt suunnilleen samassa tilanteessa kuin Wuhanissa joulukuussa. Siten varsinainen "paska osuu tuulettimeen" meininki täällä päin vasta maaliskuussa.
Toki mitään kokonaisia kaupunkeja tms. on turha Euroopassa koittaa eristää, koska se leviäminen tapahtuu maantieteellisesti laajalti.

 

[gulliver]

Ja maaliskuussa kevään lämmön ja auringon myötä ... Flunssat oli niillä nimi tai ei kuolevat pois.

 

[Kautium]

Ja maaliskuussa kevään lämmön ja auringon myötä ... Flunssat oli niillä nimi tai ei kuolevat pois.

Ei niitä silloin ole mikään muu tappamassa kuin että ihmiset eivät vuoda räkää niin paljon ja leviäminen on siksi hieman maltillisempaa, mutta ei se aurinko mitenkään maagisesti viruksia tapa ja lämpöä ei ole kuin suorassa paahteessa niin paljoa, että virus kuolisi edes pinnoilta.

 

[ichijiro]

Kylmät ilmat aiheuttavat sairastumisia sen takia, että kylmissään olevat ihmiset kärsivät alentuneesta vastustuskyvystä.

Pukeutumalla lämpimästi ja pesemällä kädet pysyy hyvin terveenä.

 

[halcyon]

Vaihteeksi tästä numerokiistelystä (jota en pidä hedelmällisenä, kun kenelläkään ei ole varmoja/tarkkoja lukuja), raporttia ulkomaiselta medialta ja asiantuntijoilta:

FT:n podcast 5.2.2020 : "China's battle against the coronavirus"

• Kun FT:n toimittaja saapui 16.1., Wuhanissa oli yleinen tunnelma, että tilanne on hallinnassa. Tämä oli myös Wuhanin paikallishallinnon virallinen tiedoituslinja
• Tilanne muuttui paljon kun keskushallinto laittoi Wuhanin karanteeniin 22.1.
• Ihmiset ovat vihaisia paikallispoliisille Wuhanissa, jotka estivät lääkäreitä joulukuussa varoittamasta ihmisiä tunnistamattomasta uudesta keuhkokuumeesta
• verrattuna SARS (2003) -epidemiaan, tämä leviää paljon nopeammin, oireettomammin ja on haastavampi kontrolloida leviämästä
• SARS-epidemiassa (2003) oikeat tartuntaluvut vuodettiin Kiinasta vasta 6kk epidemian alkamisen jälkeen, niin kauan Kiinan hallinto pystyi peittelemään tilannetta ja valehtelemaan tartuntaluvuista
• Kiinan talouden asiantuntijat ovat laskeneet Kiinan BKT-ennustetta ~-2% vuodelle 2019, perustuen tähän saakka tapahtuneeseen ja arvioon siitä, kuinka nopeasti tuotanto teollisuudessa saadaan takaisin ylös. Mikäli epidemia jatkuu vielä kaksikin kuukautta, tulee talousseuraamukset olemaan (myös globaalisti) huomattavasti suuremmat/vakavammat
• Paikallisesti ihmiset ovat Wuhanissa epäilevät virallisia lukuja epidemiasta, eivätkä luota keskushallintoon
• Kiinan sosiaalisessa mediassa on jo annettu yleisen kritiikin levitä paikallishallintoa kohtaan, mutta keskushallintoa ei vieläkään saa kritisoida. Kommentoijat pitävät tätä merkkinä siitä, että paikallishallinto tullaan uhraamaan syyllisinä tämän epidemian leviämiseen

Lähde: China's battle against the coronavirus

Society for Epidemomiological Research Podcast 5.2.2020 : Coronavirus
Mukana: Dr. Justin Lessler, Associate Professor at Johns Hopkins Bloomberg School of Public Health
ja

• Dr. Michael Mina, Assistant professor of Epidemiology and Immunology at Harvard School of Public Heath
  Epidemologit pitävät epätodennäköisenä, että taudin leviäminen jää Kiinaan ja ulkomaisiin yksittäistapauksiin ulkomailla (ts. uskovat, että epidemioita tulee myös muissa maissa)
• Nyt on kyse epidemiaan varautumisesta ja sen hidastamisesta, eikä enää sen estämisestä
• Todelliset tartuntaluvut ovat aivan varmasti suuremmat kuin ilmoitetut viralliset/tunnistetut
• CFR-arviot kuolleisuudesta menevät väärin juuri sen takia, että ei ole tarkkaa tietoa, milloin ihmiset saaneet tartunnan, milloin sairastuneet ja aina ei edes milloin kuollet
• Nykyiset kuolleisuusarviot voivat olla liian suuria, kun mukaan otetaan kaikki ihmiset, jotka voivat saada tartunnan
• Nykyiset CFR-arviot (kuolleet sairastuneista hoidossa olevista) taas voivat olla alakanttiin
• Kaikissa luvuissa on kuitenkin todella paljon epävarmuutta, tarkkoja arvioita ei voi antaa
• R0:n arviot myös epävarmoja, todennäköisesti (nykyisen tiedon valossa) välillä 2-3 tällä hetkellä, nykyisillä toimenpiteitä ja nyt leviävässä populaatiossa (kaikki nämä vaikuttavat R0-arvoon)
• On myös mahdollista, että vaikka R0 on suurempi kuin kausiflunssalla, että 2019-nCoV tartunnat kasvavat hitaammin kuin kausiflunssassa, koska tartuttavuus (kuinka nopeasti tartunnasta voi itse tartuttaa) ei vaikuta nyt olevan yhtä suuri kuin influenssalla
• Nopeammin oireita saavat, esim. nuoret, joilla on tehokkaampi immuunipuolustus, voivat tartuttaa nopeammin kuin vanhat/iäkkäät (pysyvät liikkeessä, oireet voivat olla lieviä, tapaavat paljon muita)
• Laskennallinen R0 luku 2 voidaan saada aikaan niin, että jokainen tartunnan saada niin, että jokainen tartunnan saanut tartuttaa kaksi uutta ihmistä, TAI esim. niin, että kymmenestä tartunnan saaneesta yhdeksän ei tartuta ketään ja se viimeinen yksi, ns. supertartuttaja, tartuttaa 20 henkilöä
• Tämän takia on tärkeää pystyä kontrolloimaan juuri ns. supertartuttajat (esim. sairastunut hoitohenkilökunta) ja ns. supertartuttamistilanteet (esim. isot julkiset tilaisuudet, joissa ihmiset ovat läheisessä vuorovaikutuksessa keskenän), joissa yksi taudinlähde voi tartuttaa todella suuren joukon ihmisiä.
• Taudin vakavuutta arvioitaessa pelkkä kuolleisuus (tai CFR) ei ratkaise, vaan ns. sairastuvuusluku, eli kuinka moni saa vakavia oireita. Kun suuri määrä saa kerralla vakavia oireita, niin julkisen terveydenhuollon kapasiteetti käsitellä potilaita heidän tarvitsemallaan hoitotavalla voi ylittyä, mikä taas pahentaa kuolleisuuslukuja.
• Tärkeintä tässä teoriassa on kuka saa vakavia oireita, eikä se, kuka sairastuu. On epätodennäköistä, että nuoret/lapset eivät saisi tartuntaa, vaan he eivät saa vakavia oireita.
• ACE2-reseptori 2019-nCoV -viruksessa viittaa siihen, että riskiryhmässä ovat hengitystie-, verenpaine-, verenkiertoelimistön ja aineenvaihdunnan (esim. diabetes) sairauksista kärsivät ihmiset.
• Nyt on aika varautua: desinfioi käsiäsi huolella, harkitse että otat kausiflunssarokotteen (että sinulla ei ole jo toista infektiota pohjalla), kasvomaskien käyttö tuskin hyödyllistä, ellet ole suoraan etulinjassa
• Suurin riski epidemologisesta näkökulmasta on suuri määrä tartunnan saaneita kerralla, mikä johtaa paniikkiin, testaus- ja hoitokapasiteetin ylittymiseen ja siihen, että ihmiset alkavat valehdella omista tai läheisten tartunnasta (kaikki nostavat taudin leviämisen riskiä)
• Tärkeintä viranomaisille on pitää populaatio rauhallisena, ja rehellisenä, jotta tartunnan saaneet kertovat nopeasti/rehellisesti tartunnoista, jotta syntyvät tartuntatapaukset saadaan nopeasti hoitoon/karanteeniin, ennen kuin tauti ehtii levitä enempää.
• Rokotteen kehitysnopeus on nopeutunut paljon vuodesta 2003, mutta optimistisestikin ensimmäisen ehdokkaan käyttöön saaminen vie vähintään kuukausia, ehkä vuosia, tai ehkä toimivaa ei saada lainkaan.
• Kausiflunssan tartunnan saaminen (eivät vaikutukset) on toki isompi riski yksilölle tällä hetkellä. Terveydenhuoltojärjestelmän toimivuudelle 2019-nCoV taas on isompi riski, koska niin moni enemmän tarvitsee intensiivistä hoitoa ja hoitokapasiteetti ei riittäisi, jos leviäminen olisi yhtä nopeaa/laajaa kuin kausiflunssalla.
• Milloin tiedämme paremmin, onko epidemia ohi, kuinka se saatiin hallintaan ja mikä tämän viruksen pysyvyys populaatiossa on: arviolta n. 14kk päästä tiedämme paremmin (eli yli vuoden päästä)
• Nyt kun matkustuskieltoja- ja karanteeneja on jo otettu käyttöön, niitä yleensä puretaan konservatiivisemmin/hitaammin.
• Nämä kaikki ovat nykyisiä arvioita, ja jo puolentoista viikon aikana molempien asiantuntijoiden arviot ovat muuttuneet vakavammiksi, kun uutta tietoa on tullut. Voi olla, että kahden viikon päästä olemme taas eri mieltä, tilanne elää nopeasti.

Lähde: Epidemiology Counts – Episode 12 – “Coronavirus” | Epidemiology Counts

 

[mRkukov]

• Kun FT:n toimittaja saapui 16.2., Wuhanissa oli yleinen tunnelma, että tilanne on hallinnassa. Tämä oli myös Wuhanin paikallishallinnon virallinen tiedoituslinja
• Tilanne muuttui paljon kun keskushallinto laittoi Wuhanin karanteeniin 22.2.

Ei tämä vielä vuotta ole riehunut. Nyt on helmikuun kuudes.

 

[varadruidi]

• Miksi Kiina on laittanut viimeisten tietojen mukaan osittaiseen karanteeniin/liikkumiskieltoon yli 30 kaupunkia ja yli 150 miljoonaa ihmistä? Ja on valmis ottamaan jopa 2+% BKT laskun kansantalouteensa

Kiinalla on tietysti paras tilannekuva tästä kriisistä. Uskoisin, että muut (tiedustelun) suurvallat eli Yhdysvallat ja Venäjä ovat myös paremmin perillä tilanteesta, ja sopisi myös olettaa, että tietoa on myös jaettu tärkeimmille kumppaneille eli esim. Israelille.

Niin Yhdysvaltojen kuin Kiinan valitsemassa strategiassa toimitaan tietysti markkinaehtoisesti, eli tiedetään kyllä mitä luultavammin on tulossa, mutta iskua vaimennetaan niin paljon ja pitkälle kuin vain on mahdollista.

Kiinan ilmoittamat luvut on suunnattu Kiinan omalle väestölle ja ne ovat tietenkin vain pelkkiä lukuja. Oletettavasti Kiinalla on käytössään hyvinkin tarkkoja selvityksiä sairastuneiden määristä, ja alusta saakka on tehty myös ennusteita, joihin nojaten on päädytty karanteeneihin ja muihin kansalaisoikeuksia kaventaviin ratkaisuihin. Kiinassa taatusti ymmärretään myös se, että tässä vaiheessa vain harva kiinalainen uskoo enää lukuihin, mutta siellä on ehkä jopa yllätytty siitä, kuinka orjallisesti länsimedioissa niihin vielä tukeudutaan.

Jos Remdesivir tai muut lääkehoidot eivät tarjoa nopeaa ulospääsytietä tästä kriisistä on edessä yhä vaikeammaksi muuttuva kevät. Tuotantoketjut häiriintyvät jo nyt, ja matkailuala ottaa siipeensä jo Suomessakin. Mielestäni mikään ei viittaa vielä siihen, että huippu olisi vielä lähimaillakaan. Uskaltaisin kuitenkin väittää, että viimeistään huhtikuussa painopiste on kuitenkin siirtynyt jo toisaalle, jolloin Kiina on jo alkanut toipumaan tästä kriiisistä.

 

[kurkimies]

Selviääkö lapsi tästä?

Vauvalla todettiin koronavirus vain 30 tuntia syntymän jälkeen – tartuntatapa mysteeri

 

[IhmeellinenJuttu]

Miksei selviäisi? Ihan perushengitystiesairaus kyseessä, saattaa tarvita sairaalahoitoa lähinnä nestehoidon ja mahdollisesti hengityksen tukemisen vuoksi esim. hapella. Keuhkokuume on ihan normaali tauti lapsillakin.

 

[?..]

Selviääkö lapsi tästä?

Vauvalla todettiin koronavirus vain 30 tuntia syntymän jälkeen – tartuntatapa mysteeri

Luultavasti mutta yli 15000 muuta lasta kuolee joka päivä.

 

[Lerbatov]

Luultavasti mutta yli 15000 muuta lasta kuolee joka päivä.

Ilmeisesti ei kuitenkaan koronavirukseen. Ihmisiä tuppaa kuolemaan erinäisiin syihin joka päivä aika monta

 

[Zeppelin]

BBC haastatteli Wuhanilaista naista eilen:

Coronavirus in Wuhan: ‘We’d rather die at home than go to quarantine’

Speaking from the epicentre of the outbreak, Wenjun Wang describes her family's difficulty getting treatment.

www.bbc.com

Näyttäisi olevan sairaalapaikat ja testikitit lopussa, ihmiset sairastavat ja kuolevat kotonaan.

 

[David ":DA" Imodium]

ACE2-reseptori 2019-nCoV -viruksessa viittaa siihen, että riskiryhmässä ovat hengitystie-, verenpaine-, verenkiertoelimistön ja aineenvaihdunnan (esim. diabetes) sairauksista kärsivät ihmiset.

En tiedä uskaltaako Biorxiviin enää viitata ja pieni n muutenkin, mutta tällainen mielenkiintoinen pointti löytyi ACE2:sta:
"A comparison between eight individual samples demonstrated that the Asian male one has an extremely large number of ACE2-expressing cells in the lung. "
Lähde: Single-cell RNA expression profiling of ACE2, the putative receptor of Wuhan 2019-nCov

Nähtävästi tämä mekanismi tunnettiin jo ennen 2019-nCoV:
"Isolation and characterization of a bat SARS-like coronavirus that uses the ACE2 receptor"

Isolation and characterization of a bat SARS-like coronavirus that uses the ACE2 receptor - PubMed

The 2002-3 pandemic caused by severe acute respiratory syndrome coronavirus (SARS-CoV) was one of the most significant public health events in recent history. An ongoing outbreak of Middle East respiratory syndrome coronavirus suggests that this group of viruses remains a key threat and that...

www.ncbi.nlm.nih.gov

"Phylogenetic analysis shows the possibility of direct transmission of SARS from bats to humans without the intermediary Chinese civets, as previously believed. "

Bat SARS-like coronavirus WIV1 - Wikipedia

en.wikipedia.org

 

[Cereal killah]

Meinaako Kiina tehdä joskus jotain tuolle lepakkojen syömiselle? Ei varsinaisesti kuulosta herkkuruoalta, ja kaupan päälle saavat nämä muutaman prosentin tappiot BKT:hen.