DNA testit?

[Kahakka]

Jos unohdetaan nuo väärinkäyttömahdollisuudet, niin mitä aikoisit tehdä saamallasi datalla, kun Dante lähettäisi sulle tuolla testillä tehdyt tulokset?

Itse lähinnä ajattelen, että data toimisi motivaationa ruveta oikeasti perehtymään asiaan, ja seuraamaan kyseisen tieteenalan kehittymistä, kun on omaa dataa, jonka ymmärtämiseen kyseistä lisätietoutta voisi konkreettisesti hyödyntää. Olen huono motivoimaan itseäni perinpohjaisesti selvittämään jotakin asiaa, jos tunnen sen jäävän vain pelkän "teorian" tasolle.

Joten, en pysty tässä vaiheessa tarkasti sanomaan "mitä ajattelin datalla tehdä". Koska ajattelen asiaa lähinnä lähtölaukauksena pitemmälle "projektille" alaan perehtymisessä. Uskon kuitenkin että saisin kyseisen tiedon tiimoilta itselleni jotain mielenkiintoista puuhastelua aikaiseksi. Ei ole mitään syytä olettaa ettei WGS-datan analysointi ja hyödyntäminen olisi tulevaisuudessa nopeasti kehittyvä ja panostettu ala.

Tietysti ihan noi Dante Labsin toimittamien raporttien löydökset ois kanssa kiinnostavaa lukea. Ja toisaalta kyse on toki ihan uutuudenviehätyksestäkin, ois kiva olla edes joskus "ensimmäisten" joukossa jossakin asiassa.

 

[samim]

Sitä tuossa ajattelinkin, että pelkkä ”numeromuotoinen” DNA on lopulta aika hyödytöntä. Se mielenkiintoisuus tulee, kun dataa osataan tulkita tai verrata johonkin. Tulkinta voi kertoa, että on geenejä, jotka altistavat tutkitun jollekin. Vertaaminen edellyttää, että on vertailudataa.

Dante kaiketi tarjoaa jotakin tulkintapalvelua noille tuloksille, mutta lienee kovin vähissä paikat, jotka osaavat tulkita dataa enemmän kuin Dante. Vertaamisen osalta, lähisukulaisuuden selvittäminen on helpompaa tietyllä ja pienemmällä datamäärällä, eikä kovinkaan moni sukututkimusfirma taida tarjota mahdollisuutta hyödyntää Danten tuloksia.

Joten itse kyllä suosittelisin aloittamaan edullisimmilla vaihtoehdoilla kuin Dante, isolle massalle tarjotuilla palveluilla.

 

[vemkki]

Joten itse kyllä suosittelisin aloittamaan edullisimmilla vaihtoehdoilla kuin Dante, isolle massalle tarjotuilla palveluilla.

Joo, samaa mieltä. Danten palvelu on ihan lupaava, mutta itse vähän epäilen että voi mennä aika monta vuotta ennen kuin siitä saadaan kaikki irti. Tavallisemman serkkutestin dataa voi hyödyntää useissa palveluissa (siitä saa myös aika paljon terveystietoa irti), mutta Dantesta saa ymmärtääkseni kymmenien gigojen kokoisen datatiedoston, joka ei sellaisenaan käy minnekään.

Osa suositus on seuraavanlainen:
- Serkkutesti MyHeritagesta tai Family Tree DNA:sta
- Jos on ottanut testin toisesta palvelusta, niin voi uploadata datan toiseen
- Täältä sitten datatiedostolla terveystietoa ilmaiseksi: Free comprehensive genetic report

Itsellä on Family Tree DNA:sta koko testisetti otettuna, ja saman DNA-datan olisi saanut halvemmalla Danten tai Nebulan kautta, mutta tuo datan jatkohyödyntäminen tökkii noiden palveluiden kanssa. Itseäni tosin kiinnostaa eniten sukututkimukselliset asiat, ja Family Tree DNA on siitä kenkku, ettei se huoli ulkopuolelta muuta kuin serkkutestidataa. Itselläni on siis serkkutestin lisäksi myös Y-DNA- ja mitokondrio-DNA-testit tehtyinä. Y-DNA-dataa voi lähettää YFull-palveluun, mutta Family Tree DNA:n käyttäjämäärä on paljon suurempi ja haplopuu laadukkaampi, joten osumia tulee todennäköisesti paremmin.

 

[Chromatin]

Eri mieltä muutaman edellisen kirjoittajan kanssa. Danten data on erittäin mielenkiintoista. Onhan se älyttömän hienoa kun harrastelija voi sekvenoida koko genominsa ja selvittää mitä sieltä löytyy. Hauska jo pelkästään älyllisenä harrastuksena/projektina. Ei oikeastaan sen kummempi kuin yksinkertainen ohjelmointiprojekti. Apua saa foorumeilta jne. Motivoitunut harrastaja saa kyllä datasta selville mitä haluaa ainakin kohtuullisella varmuudella.

Nimimerkillä "vuosikausia lähes kaikenlaista genomidataa analysoineena".

 

[Pluribus]

Nyt saisi halvan testin. Taitaa olla alin hinta koskaan. Voimassa tämän vuorokauden loppuun Utahin (USA) aikaa.