Myös Fedoran atomiset versiot Kinoite ja Silverblue (ja oliko niitä muitakin) menee tähän suuntaan, missä on "System software" joka sisältää sen käyttöjärjestelmän sekä joitain perussovelluksia. Varsinaiset sovellukset sitten asennetaan flatpakkeina. Silti raja on ainakin toistaiseki vähän häilyvä, kun vaikkapa tiedostoselain ja Firefox on natiiveina paketteina. Näistä jälkimmäinen kaiketi siirtyy aikanaan flatpakiksi, mutta se ensimmäinen onkin sitten jo makuasia, että onko se "osa käyttöjärjestelmää" vai "sovellus".Esimerkiksi OpenBSD:n tapauksessa raja käyttöjärjestelmän ja sovellusten välillä on ehkä vähän selkeämpi. Siinä on selkeästi erotettu ns. "base system", joka sisältää kernelin, bootloaderin jne. ja erilaisia perus daemoneja ja työkaluja, sekä Xorg:in. Sitten on ns. "ports" kokoelma, jossa on erilaisia ulkopuolisia sovelluksia, jotka ei virallisesti kuulu tuohon käyttöjärjestelmään.